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June 20, 2018
05 - REFERÊNCIAS
Referências para a aula 5.
January 01, 2020
05 - Loose Ends!
Revisão do curso e discussão de alguns tópicos que sentimos que precisam ser discutidos com mais detalhes, como controle de qualidade pré-assembly.
June 19, 2018
04 - REFERÊNCIAS
Referências para a aula 4.
04B - PHYLOGENETICS
Um resumo geral sobre phylogenética na era do sequenciamento de DNA de alto desempenho, com foco para problemas específicos nos trabalhos de bioinformática.
04A - COMPARISON
Estratégias tradicionais de comparações de genomas.
June 13, 2018
03C - ANNOTATION
Anotação de sequências e sua implicação na filogenética.
03B - DATABASES
As funções e peculiaridades de diversas bases de dados, incluindo GeneBank e UniProt.
03A - SEARCH
FASTA, BLAST, e HMMs.
03 - REFERÊNCIAS
Referências para a aula 3 (partes 1 a 3).
June 12, 2018
02B - REFERÊNCIAS
Referências para a aula 2b.
02B - ALGORITHMS
Algorítimos, BTW, alinhamento, digrafos de Bruijin e sapos saltitantes.
02A - REFERÊNCIAS
Referências para aula 2a.
02A - ASSEMBLY
Promesas e armadilhas de HTS. Um breve histórico dobre RNA-Seq e epigenômica. Que plataforma e biblioteca usar? Com referência ou de novo?
June 11, 2018
Nosso glossário
Um glossário de mais do que só palavras para o bioinformata em treinamento. Este arquivo estará em constante edição. Mande suas sugestões!
June 07, 2018
Formulário para grupos da hackatona
Formulário do Google Drive para organizar o trabalho dos grupos. Respostas podem ser editadas depois de submetidas.
June 06, 2018
01 - EXERCÍCIOS
Exercícios para a segunda aula.
01 - REFERÊNCIAS
Referências para a segunda aula.
01 - SENTA QUE LÁ VEM HISTÓRIA!
Slides da segunda aula.
June 05, 2018
00 - Para quem não sabe nada de Linux
Material de apoio para a primeira aula (gere o PDF no Overleaf).
00 - Para quem não sabe nada de computação de alta eficiência
00 - Pseudo-código
Material adicional para a primeira aula (gere o PDF no Overleaf).
00 - MIND THE GAP!
Slides da primeira aula.
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